Kirken hadde opprinnelig et Rieger-orgel. Det gamle orgelet ved siden av koret stod ferdig i 1903. Kirken fikk nytt orgel i 1932 med 39 stemmer og 2728 piper fra J.H. Jørgensen. I 2007 ble det byttet ut med et orgel fra Orgelbau Goll i Luzern i Sveits. Orgelet har 54 stemmer og er blant de største i Oslo. I tillegg har kirken et kisteorgel fra 1990 fra Ryde og Berg. De to kirkeklokkene kommer fra det som nå kalles Olsen Nauen Klokkestøperi.
Orgelet
Vi i Fagerborg har et av Oslo største orgler.
