Begrunnelsen for gjenmuringen var at de ikke skulle konkurrere med altertavlen om oppmerksomhet. Oslo domkirke ble i 1950 ført tilbake til sin opprinnelige barokke stil. Det gamle barokk-alteret ble tatt ut i 1850 da kirken framstod i ny-gotisk stil. Det sammen skjedde med prekestolen. Det er altertavlen, prekestolen og orgelfasaden som utgjør de tre viktigste barokk-elementene i kirkens interiør. De to glassmaleriene i veggen bak alteret er fra 1903.
Gjenoppdagede glassmalerier
Ved kirkens siste restaurering i 2008 ble vinduene og dermed glassmaleriene på begge sider av alteret åpnet igjen. Disse hadde siden vært gjenmurt siden den store restaureringen i 1950.